Istnieje wiele gatunków anime, w tym także odpowiednich dla tradycyjnego kina aktorskiego. Owe gatunki mogą zawierać w sobie elementyakcji, przygody, historii dla dzieci, komedii, dramatu, średniowiecznego fantasy, okultyzmu, horroru, romansu, science fiction itd.
Większość anime łączy w sobie elementy kilku różnych gatunków, jak i wiele różnych tematów, co utrudnia jednoznaczne ich kategoryzowanie. Może wydawać się, że dane anime ma prostą fabułę, ale jednocześnie może cechować się ono o wiele większą złożonością, głębokością przedstawionej historii oraz jej bohaterów. Przykładowo, w jakimś anime największy nacisk położono na akcję, np. efektowne bijatyki lub pościgi, ale jednocześnie w tym samym filmie (serialu) znaleźć można elementy m.in. humoru.
Nazwy i krótkie opisy pojęć charakterystycznych dla anime i mangi:
anime progresywne – „film artystyczny”, produkcja łamiąca jakieś kanony; termin trudny do jednoznacznego zdefiniowania, stąd też nie można podać konkretnych przykładów anime progresywnych;
bishōjo – jap. „piękna dziewczyna”, anime, w którym ważną rolę odgrywają piękne dziewczyny;
bishōnen – jap. „piękny chłopak”, anime, w którym ważną rolę odgrywają piękni chłopcy;
ecchi – anime o podtekstach erotycznych, niewybrednym humorze erotycznym, aczkolwiek bez pokazywania stosunków płciowych;
josei – jap. „młoda kobieta”; anime przeznaczone dla młodych kobiet, rzadko spotykane;
mecha – anime z wielkimi robotami lub humanoidami;
moe – anime lub manga zawierające postaci bardzo zuchwałe lub słodkie;
seinen – anime przeznaczone dla starszej młodzieży;
shōjo – jap. „młoda panienka” lub „mała dziewczynka”; anime przeznaczone głównie dla dziewczyn, np. Ore Monogatari!!, lub Kimi ni Todoke.
shōnen – jap. „chłopiec”; anime przeznaczone głównie dla chłopców, np. Naruto, lub Dragonball
mahō-shōjo (magical girls) – anime o nastoletnich bohaterkach, posiadających nadprzyrodzone moce;
mahō-shōnen (magical boys) – odpowiednik mahō-shōjo z chłopcami;
shōjo-ai – jap. „dziewczęca miłość”, anime o romansach między żeńskimi postaciami;
shōnen-ai (lub BL, boys love) – jap. „chłopięca miłość”, anime o romansach między męskimi postaciami.